A extensão do arquivo PDB significa " banco de dados de proteínas " e contém em si um texto descrevendo a estrutura tridimensional de proteínas moleculares . Ela é utilizada para armazenar a informação no banco de dados de proteínas , que é uma base de dados cada vez maior que organiza todas as proteínas conhecidas . O tipo de arquivo FASTA é usado pelo software de análise de DNA para fazer representações bidimensionais das proteínas e avaliar a sua similaridade. PDB pode ser convertido em ficheiros FASTA , de modo que estas representações bidimensionais de proteínas pode ser estudada . As representações bidimensionais são muito mais simples de analisar e comparar do que a versão tridimensional , e é por esta razão que , por vezes, os pesquisadores preferem fazer o seu trabalho em software FASTA . Coisas que você precisa
computador com Windows XP, Vista ou 7
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Baixe a Proteína avançada Converter seqüência ligado em Recursos. Este é o único software disponível que irá converter PDB para FASTA .
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Instale a Proteína avançada Sequence Converter em seu computador.
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Abra a Proteína avançada programa Converter seqüência.
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Clique em "Arquivo " e depois " Open File ".
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Selecione o arquivo PDB da janela do navegador que se abre.

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Clique em " Abrir".
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Escolha " Para FASTA Format" no "Export " título no lado inferior direito do programa .
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Clique em " Opções" e depois em " Configurações".
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Escolha o comprimento da corda que você prefere o seu arquivo FASTA a ser exportado para .
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Clique em "OK . "
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Clique no botão" Exportar " . Seu arquivo PDB será agora convertido em um arquivo FASTA com os comprimentos de cordas de proteína que você designou .