O F-16 não usa um sistema operacional de uso geral, como Windows ou Linux. Em vez disso, ele usa um sistema operacional em tempo real (RTOs) . Os RTOs específicos varia de acordo com a variante do F-16 e de suas atualizações de sistemas de missão, mas são proprietários e não são nomeados publicamente. Esses Rtoses são altamente especializados e otimizados para os requisitos exigentes de controle de vôo e sistemas de armas.