PDB significa Banco de dados de proteínas. É um repositório de dados estruturais tridimensionais de grandes moléculas de significado biológico, como proteínas, DNA e RNA. O PDB é um arquivo mantido pelo Worldwide Protein Data Bank (wwPDB), um consórcio do Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), do European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) e do Protein Data Bank Japan (PDBj). O PDB contém estruturas de biomoléculas determinadas experimentalmente, incluindo coordenadas atômicas, condições experimentais e outros dados relevantes. Os dados do APO estão disponíveis gratuitamente ao público e são utilizados por cientistas para investigação, educação e concepção de medicamentos.