Existem algumas maneiras de abrir um arquivo PDB.
Use um editor de texto.
Os arquivos PDB são arquivos de texto simples, portanto você pode abri-los com qualquer editor de texto, como o Bloco de Notas ou o WordPad. No entanto, não será possível visualizar a estrutura 3D da molécula em um editor de texto.
Use um visualizador PDB.
Existem muitos visualizadores de PDB diferentes disponíveis, tanto gratuitos quanto comerciais. Algumas opções populares incluem:
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PyMOL: Um visualizador de PDB gratuito e de código aberto com uma ampla gama de recursos.
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VMD: Um visualizador de PDB gratuito e de código aberto que é particularmente adequado para visualizar moléculas grandes.
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Quimera: Um visualizador comercial de PDB conhecido por sua interface amigável e amplo conjunto de recursos.
Para abrir um arquivo PDB em um visualizador PDB, basta selecionar o item de menu Arquivo> Abrir e navegar até o arquivo PDB que deseja abrir. O visualizador PDB irá então carregar o arquivo e exibir a estrutura 3D da molécula.
Use um navegador da web.
Existem também vários navegadores da web que podem exibir arquivos PDB. Algumas opções populares incluem:
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Banco de dados de proteínas RCSB: O site oficial do Protein Data Bank, que hospeda uma grande coleção de arquivos PDB.
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Visualizador Mol*: Um visualizador PDB gratuito e de código aberto baseado na web que permite visualizar a estrutura 3D das moléculas em seu navegador.
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JSmol: Um visualizador PDB gratuito e de código aberto baseado em Java que permite visualizar a estrutura 3D das moléculas em seu navegador da web.
Para abrir um arquivo PDB em um navegador da web, basta copiar e colar o ID do PDB na barra de pesquisa do navegador da web. O navegador da web carregará o arquivo PDB e exibirá a estrutura 3D da molécula.
