Não existe um "sistema operacional de microscópio" da maneira que existe um sistema operacional Windows ou MacOS para um computador. Os microscópios não têm seus próprios sistemas operacionais independentes.
Em vez disso, a funcionalidade de um microscópio moderno, especialmente os avançados, é controlada por:
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Software incorporado: Microscópios sofisticados geralmente possuem software incorporado (firmware) que é executado em um microcontrolador ou processador semelhante dentro do próprio microscópio. Este software controla as funções básicas, como foco, movimento de estágio, intensidade de iluminação e, às vezes, até a captura de imagens em um nível muito básico.
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software de computador: Operações mais complexas, processamento de imagens, análise de dados e recursos de controle avançado geralmente requerem um computador que executa o software especializado. Este software se conecta ao microscópio (geralmente via USB, Ethernet ou outras interfaces) e atua como uma interface entre o usuário e o hardware do microscópio. O software, não um sistema operacional dentro do próprio microscópio, fornece a interface e os controles do usuário. Este software pode ser executado no Windows, MacOS ou Linux.
Em suma, o controle de um microscópio é alcançado através de uma combinação de firmware incorporado e software de computador, não um sistema operacional de microscópio dedicado.