O SDF (formato de dados da estrutura) é usado principalmente para representar as estruturas químicas de moléculas . É um formato de arquivo amplamente usado em química química e química computacional. Um arquivo SDF pode conter uma ou mais moléculas, cada uma com suas informações estruturais associadas e possivelmente propriedades adicionais.

As informações codificadas em um arquivo SDF podem incluir:

* conectividade molecular: Os átomos e ligações que compõem a molécula.
* Tipos de átomos: O tipo de elemento de cada átomo (por exemplo, C, H, O, N).
* coordenadas de átomos (3d): A localização espacial de cada átomo, permitindo a visualização da estrutura 3D da molécula.
* Propriedades moleculares: Vários dados associados à molécula, como peso molecular, logp (coeficiente de partição octanol-água), cordas de sorrisos, chave de polegada, etc.

Os arquivos SDF são normalmente baseados em texto e utilizam um formato específico com linhas começando com `> ` para denotar propriedades e blocos de dados que contêm as informações de átomo e ligação. Sua flexibilidade os torna adequados para armazenar grandes coleções de estruturas moleculares e seus dados associados, tornando -os uma escolha popular para bancos de dados e aplicativos de triagem virtual.