Não há um único documento que se encaixe nessa descrição. A idéia de um documento "invisível" que * todo mundo * tem e pode ser excluído está incorreto. Os arquivos podem ser ocultos, mas isso não significa que todos tenham o mesmo arquivo oculto, e até arquivos ocultos podem ser acessados e excluídos com as permissões apropriadas.
Talvez você esteja pensando em arquivos do sistema, que geralmente estão ocultos para a proteção do usuário, mas eles variam muito, dependendo do sistema operacional e do software instalados. Excluí -los geralmente não é recomendado e pode causar instabilidade do sistema.