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Como extrair Unaligned lê de uma BAM
arquivos BAM são formatos binários de leitores sequenciador . Eles armazenam dados de nucleotídeos científicas em um formato compactado , misturando ambos alinhados e desalinhados lê juntos. Eles são controlados com a ferramenta " bam2fastq " , um comando de computador que vem instalado com muitos programas de nucleotídeo- seqüenciamento (você também pode obtê-lo gratuitamente . ) Para extrair o desalinhado lê um arquivo BAM , então, tudo o que você precisa é do Windows linha de comando. Instruções
1 Tipo

" bam2fastq " na barra de pesquisa do menu Iniciar para ter certeza de que a ferramenta (você não precisa abri-lo. ) Se você não fizer isso, obtê-lo gratuitamente em Recursos .
2

Digite " cmd " na barra de pesquisa do menu Iniciar. Clique em " cmd.exe" quando ele aparece acima. Isso abre a linha de comando do Windows
3

Type " bam2fastq - FILELOCATION.bam desalinhado " . . (Sem aspas ) na janela de comando
4

Substituir " FileLocation " com a localização do arquivo BAM . Use o formato de C: . \\ Pasta1 \\ Pasta2 \\ File.bam "
5

Hit" Enter " Isto irá abrir uma janela de texto com o desalinhado lê esse arquivo BAM especial < . . br>

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