Não, o FAT32 * não * suporta mais formatos de arquivo que o NTFS. Ambos os sistemas de arquivos suportam uma ampla variedade de formatos de arquivo; O próprio formato de arquivo é independente do sistema de arquivos. O sistema de arquivos simplesmente armazena os arquivos e metadados. Se um arquivo é um jpeg, um docx, um mp3, etc., é determinado por seu conteúdo e como os aplicativos o interpretam, não pelo sistema de arquivos em que reside.