Não, não há diferença funcional  entre extensões de arquivo JPG e JPG. Ambos se referem ao mesmo formato de arquivo, 
 grupo de especialistas fotográficos conjuntos (JPEG)  .  
 A diferença é puramente 
 sensível ao caso  . Alguns sistemas operacionais ou sistemas de arquivos são sensíveis ao minúsculas, enquanto outros não. Em um sistema sensível ao caso, JPG e JPG seriam considerados arquivos diferentes. No entanto, em um sistema insensível ao caso, eles seriam considerados o mesmo arquivo.   
 Na prática, você pode usar JPG ou JPG sem problemas.  É melhor manter uma convenção de nomeação consistente para seus arquivos para evitar qualquer confusão em potencial.