O Windows 98 suporta principalmente os seguintes sistemas de arquivos:
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gord16: Este era o sistema de arquivos padrão para as versões do DOS e do Windows iniciais. Era o sistema de arquivos padrão para discos rígidos menores e discos de disquete.
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FAT32: Introduzido com o Windows 95 OSR2, o FAT32 ofereceu maior capacidade de armazenamento em comparação com o FAT16 e se tornou o sistema de arquivos preferido para discos rígidos.
O Windows 98 também teve suporte limitado para o seguinte:
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ntfs: Enquanto o Windows 98 poderia ler Volumes NTFs, não poderia
escrever para eles. Isso significava que você poderia acessar arquivos nas partições NTFS, mas não poderia criar novos arquivos, pastas ou modificar as existentes.
É importante observar que o
Windows 98 não suportou nativamente outros sistemas de arquivos como ext2/3/4 (Linux) ou HFS+ (macOS).