Não, não há edição compacta do SQL Server para Linux. O SQL Server Compact foi descontinuado pela Microsoft e nunca foi apoiado oficialmente em nenhum sistema operacional que não seja de janelas. Se você precisar de uma solução de banco de dados para o Linux, considere alternativas como: 
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 postgreSQL: Um poderoso sistema de banco de dados relacional de código aberto. 
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 mysql: Outro sistema popular de gerenciamento de banco de dados relacional de código aberto. 
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 sqlite: Um mecanismo de banco de dados leve e incorporado que é frequentemente usado para aplicativos do lado do cliente, mas também pode ser usado em um servidor.   
 Embora o SQL Server da Microsoft esteja disponível no Linux, é a versão completa, não a edição compacta. A edição compacta foi projetada para aplicativos menores e incorporados, e suas limitações foram uma das razões pelas quais a Microsoft optou por interromper -a.