Os tamanhos dos arquivos FLAC variam dependendo do conteúdo de áudio, mas normalmente são maiores que os arquivos MP3. O tamanho médio de um arquivo FLAC pode variar de 20 a 50 megabytes (MB) por minuto de áudio, enquanto um arquivo MP3 do mesmo comprimento pode ter cerca de 3 a 5 MB. Além disso, o tamanho do arquivo FLAC pode ser afetado pela taxa de amostragem, profundidade de bits e número de canais.