SAM significa Mapa de Alinhamento de Sequência e é um formato padrão para armazenar dados de alinhamento de sequência. Os arquivos SAM normalmente estão localizados na mesma pasta ou diretório que os outros dados de entrada, como arquivos FASTA ou arquivos FASTQ. Eles também podem ser encontrados na pasta ou diretório de saída de um programa de análise de sequência.
